1912 yılında inşa edilen Paschaleios Archaiofilakio (eski nesnelerin deposu) olarak bilinen eski bir bina ve 1987'de modern bir binada, otomobil şirketi Volkswagen'in masrafları ile inşa edilmiştir.
Bu müze, Samos'un her yanındaki kazılarda bulunan sergilere ev sahipliği yapıyor. En etkileyici sergi, 5,5 m yüksekliğindeki dev bir kouros (erkek) heykeli. Mitolojiden ya da günlük hayattan sahneleri, çanak çömlek parçalarını, küçük heykelleri, günlük kullanım araçlarını ve bazı silahları gösteren başka heykeller ve frizler de vardır.