Tarihi Agoranın (pazar yeri) bitişiğindeki Eleftherias Meydanı’ndaki Defterdar Camisi’nin yanında bulunur. Yunan ve Roma uygarlıklarının kalıntılarının sergilendiği bir müzedir. Ayrıca, antik Kos buluntuları ile mozaik ev eşyalarını barındıran bu müzede Hipokrat’ın mermerden yapılan heykeli de sergilenmektedir.